| 1. Round | 18/09/2008 | Slaven Belupo | - | CSKA Moskva | 1:2 |  |
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| 1. Round | 30/09/2008 | CSKA Moskva | - | Slaven Belupo | 1:0 | ||||
| Group H | 23/10/2008 | CSKA Moskva | - | Deportivo La Coruña | 3:0 | |
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| Group H | 06/11/2008 | Feyenoord | - | CSKA Moskva | 1:3 | |
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| Group H | 27/11/2008 | CSKA Moskva | - | Lech Poznań | 2:1 |  |
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| Group H | 04/12/2008 | AS Nancy Lorraine | - | CSKA Moskva | 3:4 | |
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| 3. Round | 18/02/2009 | Aston Villa | - | CSKA Moskva | 1:1 | |
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| 3. Round | 26/02/2009 | CSKA Moskva | - | Aston Villa | 2:0 | |
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| Round of 16 | 12/03/2009 | CSKA Moskva | - | Shakhtar Donetsk | 1:0 | |
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| Round of 16 | 19/03/2009 | Shakhtar Donetsk | - | CSKA Moskva | 2:0 |
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