| 18. Round | 09/09/2006 | Krylia Sovetov | - | FK Moskva | 0:4 |  |
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| 19. Round | 16/09/2006 | Luch-Energiya Vladivostok | - | FK Moskva | 1:1 | ||||
| 20. Round | 24/09/2006 | Spartak Nalchik | - | FK Moskva | 2:2 | ||||
| 21. Round | 01/10/2006 | FK Moskva | - | Spartak Moskva | 3:3 |  |
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| 22. Round | 14/10/2006 | Lokomotiv Moskva | - | FK Moskva | 0:1 | |
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| 23. Round | 22/10/2006 | FK Moskva | - | Rubin Kazan | 0:5 | |
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| 24. Round | 25/10/2006 | CSKA Moskva | - | FK Moskva | 2:1 | ||||
| 25. Round | 29/10/2006 | Zenit St. Petersburg | - | FK Moskva | 1:1 | |
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