| 1. Round | 14/08/2016 | SC Paderborn 07 II | - | SuS Neuenkirchen | 0:0 | ||||
| 2. Round | 20/08/2016 | SuS Neuenkirchen | - | SuS Stadtlohn | 1:1 | ||||
| 3. Round | 27/08/2016 | TuS Erndtebrück | - | SuS Neuenkirchen | 1:3 | ||||
| 4. Round | 04/09/2016 | SuS Neuenkirchen | - | Roland Beckum | 2:2 | ||||
| 5. Round | 11/09/2016 | Hammer SpVg | - | SuS Neuenkirchen | 2:2 | ||||
| 6. Round | 18/09/2016 | SuS Neuenkirchen | - | FCE Rheine | 1:4 | ||||
| 7. Round | 25/09/2016 | TSV Marl-Hüls | - | SuS Neuenkirchen | 5:3 | ||||
| 11. Round | 23/10/2016 | Arminia Bielefeld II | - | SuS Neuenkirchen | 2:0 | ||||
| 12. Round | 30/10/2016 | SuS Neuenkirchen | - | SV Lippstadt 08 | 2:1 | ||||
| 13. Round | 06/11/2016 | Westfalia Rhynern | - | SuS Neuenkirchen | 1:1 | ||||
| 9. Round | 19/11/2016 | SpVgg Erkenschwick | - | SuS Neuenkirchen | 1:1 | ||||
| 18. Round | 18/12/2016 | SuS Neuenkirchen | - | SC Paderborn 07 II | 1:1 |
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