| 1. Round | 18/07/2024 | Wacker Burghausen | - | Bayern München II | 0:1 |  |
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| 2. Round | 26/07/2024 | Bayern München II | - | SpVgg Ansbach | 2:2 | ||||
| 3. Round | 02/08/2024 | 1. FC Nürnberg II | - | Bayern München II | 1:2 | ||||
| 4. Round | 09/08/2024 | Bayern München II | - | SpVgg Bayreuth | 4:2 |  |
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| 5. Round | 16/08/2024 | Bayern München II | - | Viktoria Aschaffenburg | 4:1 | |
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| 6. Round | 24/08/2024 | Würzburger Kickers | - | Bayern München II | 1:4 | ||||
| 20. Round | 15/11/2024 | Bayern München II | - | 1. FC Nürnberg II | 4:0 | ||||
| 21. Round | 22/11/2024 | SpVgg Bayreuth | - | Bayern München II | 1:1 | |
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| 22. Round | 30/11/2024 | Viktoria Aschaffenburg | - | Bayern München II | 0:2 | |
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| 8. Round | 06/12/2024 | FC Augsburg II | - | Bayern München II | 1:3 | |
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