| 2. Round | 04/09/2016 | Reggina 1914 | - | ACR Messina | 2:0 | ||||
| 3. Round | 11/09/2016 | ACR Messina | - | Virtus Francavilla | 1:1 | ||||
| 4. Round | 14/09/2016 | SS Juve Stabia | - | ACR Messina | 2:1 |  |
|||
| 5. Round | 19/09/2016 | ACR Messina | - | Foggia Calcio | 1:2 | ||||
| 6. Round | 25/09/2016 | US Catanzaro | - | ACR Messina | 0:1 | ||||
| 10. Round | 23/10/2016 | ACR Messina | - | Casertana FC | 2:1 | ||||
| 12. Round | 06/11/2016 | ACR Messina | - | Matera Calcio | 0:0 | ||||
| 13. Round | 13/11/2016 | ACR Messina | - | Fidelis Andria | 1:1 | ||||
| 16. Round | 03/12/2016 | AS Melfi | - | ACR Messina | 3:0 |  |
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| 23. Round | 28/01/2017 | ACR Messina | - | SS Juve Stabia | 1:0 |
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